Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctnna3Q65CL1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ctnna3Q65CL1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnna3Q65CL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ctnna3Q65CL1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ctnna3Q65CL1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctnna3Q65CL1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnna3Q65CL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctnna3Q65CL1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms