Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc3Q64519 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc3Q64519 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdc3Q64519 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc3Q64519 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc3Q64519 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc3Q64519 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdc3Q64519 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdc3Q64519 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms