Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf1Q64213 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf1Q64213 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf1Q64213 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf1Q64213 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf1Q64213 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sf1Q64213 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf1Q64213 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf1Q64213 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms