Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim24Q64127 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim24Q64127 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim24Q64127 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim24Q64127 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim24Q64127 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim24Q64127 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim24Q64127 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim24Q64127 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim24Q64127 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms