Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phc1Q64028 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phc1Q64028 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phc1Q64028 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phc1Q64028 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phc1Q64028 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Phc1Q64028 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Phc1Q64028 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phc1Q64028 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms