Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2kQ63871 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr2kQ63871 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2kQ63871 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Polr2kQ63871 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr2kQ63871 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr2kQ63871 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms