Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift52Q62559 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift52Q62559 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift52Q62559 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift52Q62559 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift52Q62559 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift52Q62559 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift52Q62559 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift52Q62559 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift52Q62559 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift52Q62559 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms