Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lcn4Q62472 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lcn4Q62472 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lcn4Q62472 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lcn4Q62472 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn4Q62472 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn4Q62472 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn4Q62472 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn4Q62472 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms