Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx3xQ62167 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx3xQ62167 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx3xQ62167 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx3xQ62167 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx3xQ62167 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddx3xQ62167 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx3xQ62167 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx3xQ62167 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms