Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HlxQ61670 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HlxQ61670 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HlxQ61670 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HlxQ61670 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HlxQ61670 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HlxQ61670 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HlxQ61670 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HlxQ61670 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HlxQ61670 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HlxQ61670 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HlxQ61670 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlxQ61670 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HlxQ61670 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlxQ61670 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlxQ61670 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlxQ61670 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlxQ61670 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlxQ61670 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlxQ61670 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlxQ61670 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms