Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rad21Q61550 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rad21Q61550 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad21Q61550 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad21Q61550 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rad21Q61550 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rad21Q61550 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rad21Q61550 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rad21Q61550 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad21Q61550 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rad21Q61550 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rad21Q61550 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms