Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vsx2Q61412 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vsx2Q61412 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vsx2Q61412 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vsx2Q61412 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vsx2Q61412 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms