Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvr1bQ61271 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvr1bQ61271 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acvr1bQ61271 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acvr1bQ61271 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acvr1bQ61271 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acvr1bQ61271 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acvr1bQ61271 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms