Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Igbp1Q61249 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Igbp1Q61249 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Igbp1Q61249 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Igbp1Q61249 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Igbp1Q61249 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Igbp1Q61249 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igbp1Q61249 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igbp1Q61249 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igbp1Q61249 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igbp1Q61249 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igbp1Q61249 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms