Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PapolaQ61183 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PapolaQ61183 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PapolaQ61183 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PapolaQ61183 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolaQ61183 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PapolaQ61183 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PapolaQ61183 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolaQ61183 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms