Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lamb3Q61087 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamb3Q61087 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamb3Q61087 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamb3Q61087 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamb3Q61087 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamb3Q61087 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamb3Q61087 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lamb3Q61087 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamb3Q61087 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamb3Q61087 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms