Protein–RNA interactions for Protein: Q60930

Vdac2, Voltage-dependent anion-selective channel protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac2Q60930 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac2Q60930 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vdac2Q60930 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac2Q60930 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac2Q60930 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vdac2Q60930 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vdac2Q60930 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vdac2Q60930 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vdac2Q60930 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vdac2Q60930 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vdac2Q60930 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.8 ms