Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DbpQ60925 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DbpQ60925 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DbpQ60925 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DbpQ60925 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DbpQ60925 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DbpQ60925 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DbpQ60925 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DbpQ60925 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DbpQ60925 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DbpQ60925 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DbpQ60925 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DbpQ60925 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DbpQ60925 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DbpQ60925 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DbpQ60925 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DbpQ60925 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DbpQ60925 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DbpQ60925 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DbpQ60925 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DbpQ60925 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms