Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelnQ60841 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RelnQ60841 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelnQ60841 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RelnQ60841 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelnQ60841 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelnQ60841 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RelnQ60841 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RelnQ60841 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelnQ60841 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelnQ60841 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RelnQ60841 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RelnQ60841 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelnQ60841 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelnQ60841 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelnQ60841 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelnQ60841 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RelnQ60841 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelnQ60841 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelnQ60841 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelnQ60841 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelnQ60841 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelnQ60841 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms