Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn2cQ60772 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn2cQ60772 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn2cQ60772 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn2cQ60772 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn2cQ60772 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdkn2cQ60772 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn2cQ60772 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn2cQ60772 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkn2cQ60772 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdkn2cQ60772 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkn2cQ60772 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkn2cQ60772 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms