Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Atf3Q60765 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Atf3Q60765 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Atf3Q60765 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Atf3Q60765 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Atf3Q60765 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atf3Q60765 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atf3Q60765 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atf3Q60765 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Atf3Q60765 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atf3Q60765 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf3Q60765 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Atf3Q60765 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Atf3Q60765 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms