Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChukQ60680 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChukQ60680 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChukQ60680 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChukQ60680 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChukQ60680 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChukQ60680 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChukQ60680 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChukQ60680 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChukQ60680 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChukQ60680 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ChukQ60680 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChukQ60680 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChukQ60680 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChukQ60680 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChukQ60680 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChukQ60680 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChukQ60680 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms