Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr1d2Q60674 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms