Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d2Q60674 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1d2Q60674 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1d2Q60674 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1d2Q60674 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr1d2Q60674 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr1d2Q60674 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nr1d2Q60674 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nr1d2Q60674 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms