Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h4Q60641 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h4Q60641 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h4Q60641 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h4Q60641 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1h4Q60641 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h4Q60641 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h4Q60641 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h4Q60641 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms