Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpn1lQ5XFR0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpn1lQ5XFR0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpn1lQ5XFR0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpn1lQ5XFR0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpn1lQ5XFR0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpn1lQ5XFR0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms