Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa6Q5U901 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa6Q5U901 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa6Q5U901 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa6Q5U901 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpa6Q5U901 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa6Q5U901 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa6Q5U901 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpa6Q5U901 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpa6Q5U901 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa6Q5U901 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa6Q5U901 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cpa6Q5U901 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa6Q5U901 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms