Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thoc6Q5U4D9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thoc6Q5U4D9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thoc6Q5U4D9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thoc6Q5U4D9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thoc6Q5U4D9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thoc6Q5U4D9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms