Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a6Q5U4D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a6Q5U4D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc5a6Q5U4D8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc5a6Q5U4D8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a6Q5U4D8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms