Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms