Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ankrd40Q5SUE8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ankrd40Q5SUE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ankrd40Q5SUE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd40Q5SUE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd40Q5SUE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ankrd40Q5SUE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd40Q5SUE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd40Q5SUE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd40Q5SUE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms