Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf12Q5SPL2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf12Q5SPL2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf12Q5SPL2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf12Q5SPL2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf12Q5SPL2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf12Q5SPL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms