Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PkdccQ5RJI4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PkdccQ5RJI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PkdccQ5RJI4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PkdccQ5RJI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PkdccQ5RJI4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PkdccQ5RJI4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PkdccQ5RJI4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PkdccQ5RJI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms