Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms