Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Xaf1Q5NBU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Xaf1Q5NBU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xaf1Q5NBU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xaf1Q5NBU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xaf1Q5NBU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xaf1Q5NBU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xaf1Q5NBU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms