Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp13Q5BKP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp13Q5BKP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp13Q5BKP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp13Q5BKP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp13Q5BKP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp13Q5BKP2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp13Q5BKP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp13Q5BKP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms