Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Pds5bQ4VA53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Pds5bQ4VA53 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Pds5bQ4VA53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Pds5bQ4VA53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Pds5bQ4VA53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Pds5bQ4VA53 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Pds5bQ4VA53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.92
Pds5bQ4VA53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Pds5bQ4VA53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Pds5bQ4VA53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
Pds5bQ4VA53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
Pds5bQ4VA53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Pds5bQ4VA53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Pds5bQ4VA53 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Pds5bQ4VA53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Pds5bQ4VA53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Pds5bQ4VA53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Pds5bQ4VA53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Pds5bQ4VA53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Pds5bQ4VA53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Pds5bQ4VA53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Pds5bQ4VA53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Pds5bQ4VA53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Pds5bQ4VA53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Pds5bQ4VA53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
Pds5bQ4VA53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
Pds5bQ4VA53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Pds5bQ4VA53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms