Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3A1

Cdk15, Cyclin-dependent kinase 15, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk15Q3V3A1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk15Q3V3A1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk15Q3V3A1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk15Q3V3A1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk15Q3V3A1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk15Q3V3A1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk15Q3V3A1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk15Q3V3A1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk15Q3V3A1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms