Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmprss12Q3V0Q7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmprss12Q3V0Q7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmprss12Q3V0Q7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmprss12Q3V0Q7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmprss12Q3V0Q7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmprss12Q3V0Q7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmprss12Q3V0Q7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmprss12Q3V0Q7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmprss12Q3V0Q7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmprss12Q3V0Q7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmprss12Q3V0Q7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms