Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dnah12Q3V0Q1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnah12Q3V0Q1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dnah12Q3V0Q1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Dnah12Q3V0Q1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnah12Q3V0Q1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnah12Q3V0Q1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dnah12Q3V0Q1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dnah12Q3V0Q1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dnah12Q3V0Q1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnah12Q3V0Q1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms