Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hipk4Q3V016 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hipk4Q3V016 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hipk4Q3V016 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk4Q3V016 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hipk4Q3V016 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms