Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmed1Q3V009 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmed1Q3V009 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmed1Q3V009 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmed1Q3V009 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmed1Q3V009 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmed1Q3V009 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed1Q3V009 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed1Q3V009 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms