Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C87499Q3UX49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C87499Q3UX49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C87499Q3UX49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C87499Q3UX49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C87499Q3UX49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C87499Q3UX49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C87499Q3UX49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C87499Q3UX49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms