Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Clca4bQ3UW98 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca4bQ3UW98 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca4bQ3UW98 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clca4bQ3UW98 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clca4bQ3UW98 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4bQ3UW98 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms