Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm12888Q3UW77 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm12888Q3UW77 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm12888Q3UW77 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm12888Q3UW77 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm12888Q3UW77 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms