Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTZ3

Uncharacterized protein C7orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UTZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UTZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UTZ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UTZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UTZ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3UTZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3UTZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3UTZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q3UTZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3UTZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3UTZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3UTZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q3UTZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3UTZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UTZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UTZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3UTZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms