Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms