Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mccc2Q3ULD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc2Q3ULD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc2Q3ULD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc2Q3ULD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mccc2Q3ULD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mccc2Q3ULD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mccc2Q3ULD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mccc2Q3ULD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms