Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcgf5Q3UK78 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf5Q3UK78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcgf5Q3UK78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcgf5Q3UK78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcgf5Q3UK78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcgf5Q3UK78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms