Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Greb1Q3UHK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Greb1Q3UHK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Greb1Q3UHK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Greb1Q3UHK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1Q3UHK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Greb1Q3UHK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Greb1Q3UHK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Greb1Q3UHK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms