Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pitpnm3Q3UHE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pitpnm3Q3UHE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pitpnm3Q3UHE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pitpnm3Q3UHE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms