Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfod1Q3UHD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gfod1Q3UHD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gfod1Q3UHD2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfod1Q3UHD2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfod1Q3UHD2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfod1Q3UHD2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfod1Q3UHD2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfod1Q3UHD2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfod1Q3UHD2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms